אפרטהייד הוא פשע חמור, שכל אדם או מוסד שיבצע אותו מפר את החוק הבינלאומי, לפיכך האשמת מדינה באפרטהייד צריכה להתבצע בזהירות רבה. העובדה שהשטחים נמצאים תחת שלטון זמני וצבאי, ושישראל נאלצת על בסיס יומי להגן על אזרחיה מפעולות טרור המבוצעות על-ידי הפלסטינים בשטחים ובתוך הקו הירוק, שופכות אור אחר על ההתנהלות הישראלית, ולכן הופכות את הטענה שישראל מדינת אפרטהייד לריקה וחסרת בסיס.
אפרטהייד הוא אפליה מערכתית וממסדית של קבוצה אחת על פני האחרת, ואני חושב שאין הכרח שזה יהיה נוגע לגזע אלא גם להבחנות אחרות כמו לאומיות. ישראל עושה זאת גם עם כוונה לשימור הדומיננטיות שלה על חשבון הפלסטינים. הקולוניאליזם באזור הגדה של חצי מיליון ישראלים הוא בעצמו מספיק כדי להוכיח את זה. כך גם החרמת אדמות בכמות עצומה, העובדה שאף שכונה פלסטינית אחת נבנתה תחת השלטון הישראלי במשך 47 שנים, והעובדה שלא עשינו ניסיון לקצר את הכיבוש.
המחלוקת בנוגע לשטחי הגדה המערבית היא האם האפליה של הפלסטינים היא בגדר אפרטהייד. הטוענים שאין אפרטהייד מגדירים את אופי השלטון הצבאי הזמני באזור ואת בעיות הביטחון כעילות מוצדקות לאפליה שאין בהן גזענות מכוונת כמו באפרטהייד. הטוענים לאפרטהייד מעמידים את האפליה המתמשכת והבידול החוקתי בין פלסטינים לישראלים כסממן לכך שישראל מבקשת לדכא במכוון את האוכלוסייה הפלסטינית על בסיס לאומי.
